تفاصيل الوثيقة

نوع الوثيقة : رسالة جامعية 
عنوان الوثيقة :
التعرف على التنظيم الجيني والمسارات الأيضية تحت ظروف أجهادي الجفاف والحرارة في نبات السنا
Detection of gene regulation and metabolic pathways under drought and heat stresses in senna (Cassia angustifolia)
 
الموضوع : كلية العلوم 
لغة الوثيقة : العربية 
المستخلص : الهدف من هذه الدراسة هو الكشف عن الميكانيكيات الجزيئية لتحمل الإجهاد الناتج عن الجفاف في النوع النباتي البري سنا (Cassia angustifolia Vahl) التابع للعائلة Caesalpiniaceae ذات التطبيقات الصيدلانية المهمة. وقد تم دراسة مجموعات بيانات RNA-Seq الناتجة عن طريق تسلسل الجيل التالي (NGS) للأوراق النباتية قبل (اليوم 1) وبعد (اليوم 2) الري في ثلاث مراحل زمنية (بعد الفجر ومنتصف النهار وما بعد الغسق) ، وتم تجميع البيانات الأولية بطريقة de novo assembly لدراسة الاستجابة التفاضلية بسبب الري باستخدام برنامج Trinity ، كما تم التعرف على تسلسل الحمض النووي المشفر (CDS) والتعبير التفاضلي differential expression وتحليل المجموعات التعبيرية cluster analysis. وأظهر التحليل الهرمي للتعبير الجيني أن الترانسكربتومات في أي وقت معين كانت متشابهه بشكل وثيق ، باستثناء تلك التي كانت في منتصف النهار التي كانت مفصولة تماما بسبب الري. وأشار تصنيف GO وجود العديد من مسميات الـ GO المرتبطة بتحمل الإجهادات البيئية وغير البيئية. أشار تحليل المجموعات التعبيرية cluster analysis إلى حدوث العديد من أنماط التعبير المرتبطة بوجود الضوء وارتفاع الحرارة ومرحلة الفجر والليل. وتم الكشف عن استجابات الري التفاضلية فقط في منتصف النهار. وأظهرت الدراسة وجود عدد كبير من الجينات المرتبطة بعوامل الجفاف وعائلات عوامل النسخ بما في ذلك NAC و MYC2 و CCCH zinc finger (أي TZF) التي لها دور رئيسي في مراحل نمو النبات والاستجابة للظروف غير المواتية مثل الجفاف والملوحة. ونتج عن تحليل KEGG للجينات التي وصل تفاوت التعبير الجيني منتصف النهار بين اليومين خمسة أضعاف أو أكثر عددًا من الإنزيمات التي حدث لها تثبيط بسبب الري ، وبالتالي من المحتمل مشاركتها في الآليات الجزيئية التي يستخدمها هذا النبات للتكيف مع إجهاد الجفاف طويل الأمد. وتم الحصول على عدد من المركبات الحيوية والإنزيمات المنظمة منها مستقبلات حمض الأبسيسيك PYL4 و PYL9 ، وعامل استجابة أوكسين ARF 5 و 15 ARF ، و كذلك بروتينات الـ Aux / IAA المسماه IAA7 و IAA14 ، والعديد من الإنزيمات مثل indole-3-pyruvate (or flavin) monooxygenase و phosphoinositide phosphatase SAC1 and SAC6, وعوامل قطع الإنترونات introns و المسماه 8, 8A, 19, 40A and ISY1 بالإضافة إلى العوامل المنظمة لقطع الإنترونات والمسماة serine/arginine-rich splicing regulators SCL33, RS31 and RS34. وأظهر المساران الأيضان تحليل التربتوفان tryptophan metabolism ونقل الإشارة عن طريق هرمون النبات plant hormone signal transduction الحديث المتبادل أو التكامل في نبات السنا (C. angustifolia) نحو الحفاظ على النمو الطبيعي للنبات في ظل ظروف الإجهاد البيئي الضار. كذلك ظهرت استجابة العديد من المستقلبات والبروتينات الأخرى بما في ذلك مركب brassinosteroid ، بروتين الصدمة الحرارية95 ، وإنزيم ATPase ، وعدة بروتينات مثل البروتين كيناز MAPK وإنزيم أكسيداز السيتوكروم c. وتشتمل أيضاً على الإنزيمات الأخرى على فسفوليباز C2 بالإضافة إلى تلك في مسار isochorismate. في الختام يمكن القول أن الدراسة ألقت الضوء على الآليات الجزيئية المحتملة وراء تحمل إجهاد الجفاف في نبات سنا البري (C. angustifolia) والتي يمكن الاستفادة منها مستقبلاً في برامج تربية النبات. 
المشرف : أ.د. احمد بهي الدين محمد 
نوع الرسالة : رسالة دكتوراه 
سنة النشر : 1440 هـ
2019 م
 
المشرف المشارك : أ.د. حسن سعيد الزهراني 
تاريخ الاضافة على الموقع : Wednesday, August 21, 2019 

الباحثون

اسم الباحث (عربي)اسم الباحث (انجليزي)نوع الباحثالمرتبة العلميةالبريد الالكتروني
نادية بخيت السلميal-Sulami, Nadiah Bakheetباحثدكتوراه 

الملفات

اسم الملفالنوعالوصف
 44900.pdf pdf 

الرجوع إلى صفحة الأبحاث